Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms