Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms