Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms