Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms