Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms