Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms