Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms