Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SENP8Q96LD8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SENP8Q96LD8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms