Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCORQ96JN0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms