Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPDL3BQ92485 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms