Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms