Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM41Q8WV44 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms