Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms