Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms