Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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