Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms