Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms