Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C3orf33Q6P1S2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms