Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSMD4Q5XG99 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms