Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms