Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms