Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms