Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms