Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms