Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms