Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms