Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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