Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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