Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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