Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms