Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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