Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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