Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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