Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK5Q16478 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms