Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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