Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMCHL1Q16048 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms