Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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