Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms