Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CDK5R1Q15078 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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