Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GAPVD1Q14C86 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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