Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms