Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms