Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDE7AQ13946 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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