Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PKP1Q13835 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PKP1Q13835 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PKP1Q13835 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PKP1Q13835 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PKP1Q13835 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PKP1Q13835 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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