Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms