Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms