Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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