Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PMS2P3Q13401 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PMS2P3Q13401 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMS2P3Q13401 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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