Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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