Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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